Bioinformática combina a tecnologia da informação e da biologia molecular, por isso faz sentido que a Internet é a principal arena para perseguir bioinformática informações. A lista a seguir oferece links para sites úteis em todo o mundo e as áreas que se especializam em:
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Ensembl: A Human Genome
GenBank / DDBJ / EMBL: Sequência de nucleótidos
PubMed: Referências de literatura
Swiss Institiute de Bioinformática: sequências proteicas anotadas
InterProScanOs domínios proteicos:
OMIM: Doenças genéticas
GenomeNet: Vias metabólicas
Os sites de bioinformática da Web na seguinte lista oferecer ajuda na análise de sequências de DNA e RNA. E, no casamento da tecnologia da informação e da biologia molecular que é bioinformática, este tipo de análise é o que é tudo sobre.
Webcutter: Mapa de restrição
GenomeScan: Descoberta Gene
BLASTN, TBLASTN, BLASTX: Pesquisa Base de dados
O navegador do Genoma: Veja os dados finais!
MFOLD: Previsão de estrutura RNA
Com a bioinformática pode explorar a biologia molecular utilizando tecnologia da informação. Os links para os sites da Web no seguinte foco lista sequências de proteínas. Alguns oferecem bases de dados pesquisáveis, outros ajudá-lo a investigar uma única proteína-tudo são úteis:
EXPLOSÃO: Pesquisa de homologia de banco de dados
SRS: Pesquisa Base de dados
Entrez: Pesquisa Base de dados
InterProScan: Encontre domínios proteicos
ExPASy: Analisar uma proteína
ClustalW: Alinhamento de sequências múltiplas
T-Coffee: Avaliar alinhamento múltiplo
Jalview: Editor alinhamento múltipla
PSIPRED: Previsão de estrutura secundária
Cn3D: visualização e rotação estruturas 3-D
Quando você está usando a Internet para ajudar com seu projeto de bioinformática, você se deparar com os dados em todos os tipos de formatos diferentes. A tabela a seguir pode ajudá-lo a entender formatos de bioinformática comuns eo que você pode e não pode fazer com eles.
| Nome formato | Descrição |
|---|---|
| CRU | formato de seqüência que não contém qualquer cabeçalho. Espaços andnumbers são geralmente tolerada. |
| FASTA | Este é o formato padrão. formato de seqüência que contém aheader linha ea sequência: > nome AGCTGTGTGGGTTGGTGGGTT |
| PIR | formato de sequência que é semelhante ao FASTA, mas menos comum |
| MSF | formato de alinhamento de sequências múltiplas |
| CLUSTAL | formato de alinhamento de sequências múltiplas (funciona com T-Coffee) |
| TXT | formato de texto |
| GIF, JPEG, PNG, PDF | formatos gráficos. Não usá-los para armazenar importantinformation. |